První písemná zmínka o obci pochází z roku 1424.
V obci bývala synagoga z roku 1816, která byla roku 1957 zbořena (zdejší aron ha-kodeš, tedy schránka umístěná u východní zdi Synagogy, v níž jsou uloženy svitky Tóry, je vystaven v pražské Klausové synagoze).
Počátek židovského osídlení Podbořanského Rohozce se datuje k polovině 17. století a následně kontinuálně pokračuje až do druhé světové války. Svého vrcholu dosáhlo v polovině 19. století, kdy židé (celkem 290 osob) v roce 1864 tvořili 50 % všech obyvatel obce. V obci existovaly tři židovské sídelní okrsky, které v první polovině 19. století sestávaly z přibližně 26 domů. Přibližně polovina židovských domů se v různých přestavbách dochovala. V obci postupně existovaly dvě synagogy; starší, z počátku 18. století, byla v roce 1816 nahrazena novější stavbou v jižní části návsi. K bohoslužbám byla využívána do první světové války, ve 30. letech došlo k její přestavbě na obytný dům a v roce 1956 byla zbořena. Do dnešní doby se dochoval židovský hřbitov z roku 1856, asi 1000 metrů východně od centra obce, čítající na 90 náhrobků. Hřbitov byl zdevastován během druhé světové války a za minulého režimu.